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使用多个函数最简单的方法是把它们都放在同一个文件中，然后像编译只有一个函数的文件那样编译该文件即可。其他方法因操作系统而异
UNIX
假定在UNIX系统中安装了UNIX C编译器cc（最初的cc已经停用，但是许多UNIX系统都给cc命令起了一个别名用作其他编译器命令，典型的是gcc或clang）。假设file1.c和file2.c是两个内含C函数的文件，下面的命令将编译两个文件并生成一个名为a.out的可执行文件：
另外，还生成两个名为file1.o和file2.o的目标文件。如果后来改动了file1.c，而file2.c不变，可以使用以下命令编译第1个文件，并与第2个文件的目标代码合并：
UNIX系统的make命令可自动管理多文件程序。
注意，OS X的Terminal工具可以打开UNIX命令行环境，但是必须先下载命令行编译器（GCC和Clang）。
Linux
假定Linux系统安装了GNU C编译器GCC。假设file1.c和file2.c是两个内含C函数的文件，下面的命令将编译两个文件并生成名为a.out的可执行文件：
另外，还生成两个名为file1.o和file2.o的目标文件。如果后来改动了file1.c，而file2.c不变，可以使用以下命令编译第1个文件，并与第2个文件的目标代码合并：
DOS命令行编译器
绝大多数DOS命令行编译器的工作原理和UNIX的cc命令类似，只不过使用不同的名称而已。其中一个区别是，对象文件的扩展名是.obj，而不是.o。一些编译器生成的不是目标代码文件，而是汇编语言或其他特殊代码的中间文件。
使用头文件
如果把
main()放在第1个文件中，把函数定义放在第2个文件中，那么第1个文件仍然要使用函数原型。把函数原型放在头文件中，就不用在每次使用函数文件时都写出函数的原型。C 标准库就是这样做的，把I/O函数原型放在stdio.h中，把数学函数原型放在math.h中。另外，程序中经常用C预处理器定义符号常量。这种定义只储存了那些包含#define指令的文件。如果把程序的一个函数放进一个独立的文件中，也可以使用#define指令访问每个文件。最直接的方法是在每个文件中再次输入指令，但是这个方法既耗时又容易出错。另外，还会有维护的问题：如果修改了#define 定义的值，就必须在每个文件中修改。更好的做法是，把#define 指令放进头文件，然后在每个源文件中使用#include指令包含该文件即可。
